ГЕНЕТИЧЕСКАЯ СТРУКТУРА СОБОЛЯ (MARTES ZIBELLINA LINNAEUS, 1758) ПРИАМУРЬЯ: КЛАСТЕРНЫЙ АНАЛИЗ СУБПОПУЛЯЦИЙ

А.Л. Брыкова, Д.В. Родимцева, Л.В. Фрисман

Аннотация


Проведенный ранее мониторинг аллельного состава субпопуляций соболя Приамурья в охотничьи сезоны 2011–2021 гг. показал присутствие аллелей, маркирующих различия соболиного населения левобережья и правобережья р. Амур. При попарном сравнении сезонных сборов субпопуляций лево- и правобережья был обнаружен разброс уровня генетической дифференциации от практически нулевых значений до промежуточного уровня. Стало понятно, что для определения количества различающихся генетических групп соболя в данном регионе необходимо привлечение дополнительных математических методов работы с полученными данными.

Целью настоящей работы является определение и визуализация наиболее вероятного числа различающихся генетических групп соболей рассматриваемой территории. Были изучены три субпопуляции соболя Буреинского нагорья (левобережье р. Амур) и для сравнения рассмотрена одна субпопуляция c западных склонов Сихотэ-Алиня (правобережье р. Амур). Анализ данных по двум микросателлитным локусам Ma3 и Mer041 на материале охотничьих зимних сезонов с 2011 г. по 2022 г. проведен с помощью программ Structure 2.3.4 и Structure Harvester.

По результатам, полученным с помощью этих программ, можно предположить, что на рассматриваемой территории данный вид представлен двумя генетическими группами (кластерами) – «левобережной» и «правобережной». Структура сохраняется как для материала сборов рассматриваемых зимних охотничьих сезонов 2012–2013 гг. и 2013–2014 гг., так и для суммарных сборов 2011–2022 гг. Формирование такой структуры, несомненно, – результат наложения истории становления ареала вида и генетической специфики различающихся антропогенно обусловленных интродукций из двух географических районов, проводимых здесь в середине прошлого века.


Ключевые слова


соболь; кластерный анализ; генетические группы; микросателлитные локусы; субпопуляции; Буреинское нагорье

Полный текст:

PDF

Литература


ОБРАЗЕЦ ЦИТИРОВАНИЯ: Брыкова А.Л., Родимцева Д.В., Фрисман Л.В. Популяционная структура соболя (Martes Zibellina Linnaeus, 1758) Среднего Приамурья: кластерный анализ субпопуляций право- и левобережья реки Амур // Региональные проблемы. 2023. Т. 26, № 4. С. 24–32. DOI: 10.31433/2618-9593-2023-26-4-24-32.

Абрамов К.Г. Соболь в охотничьем хозяйстве Дальнего Востока. М.: Наука, 1967. 116 с.

Каштанов С.Н., Свищева Г.Р., Лазебный О.Е., Колобков Д.С., Пищулина С.Л., Мещерский С.Л., Рожнов В.В. Влияние антропогенных факторов на генетическое разнообразие вида соболь (Martes zibellina L.) // Молекулярная биология. 2015. Т. 49, № 3. С. 449–454. DOI: 10.7868/S002689841503009X.

Каштанов С.Н., Свищева Г.Р., Пищулина С.Л., Лазебный О.Е., Мещерский И.Г., Симакин Л.В., Рожнов В.В. Географическая структура генофонда соболя (Martes zibellina L.): данные анализа микросателлитных локусов // Генетика. 2015. Т. 51, № 1. С. 78–88. DOI: 10.7868/S001667581501004X.

Крестов П.В., Баркалов В.Ю., Омелько А.М., Якубов В.В., Накамура Ю., Сато К. Реликтовые комплексы растительности современных рефугиумов северо-восточной Азии // Комаровские чтения. Владивосток: Дальнаука, 2009. Вып. 56. С. 5–63.

Фрисман Л.В., Шлюфман К.В., Брыкова А.Л. Генетическая структура популяции соболя (Martes zibellina L.) Буреинского нагорья по сборам одного охотничьего сезона // Региональные проблемы. 2019. Т. 22, № 4. С. 46–55. DOI: 10.31433/2618-9593-2019-22-4-46-55.

Earl Dent A., VonHoldt B.M. STRUCTURE HARVESTER: a website and program for visualizing STRUCTURE output and implementing the Evanno method // Conservation Genetics Resources. 2012. Vol. 4. P. 359–361. DOI: 10.1007/s12686-011-9548-7.

Evanno G., Regnaut S., Goudet J. Detecting the number of clusters of individuals using the software STRUCTURE: a simulation study // Molecular ecology. 2005. Vol. 14, N 8. P. 2611–2620. DOI: 10.1111/j.1365-294X.2005.02553.x.

Falush D., Stephens M., Pritchard J.K. Inference of population structure using multilocus genotype data: linked loci and correlated allele frequencies // Genetics. 2003. Vol. 164, N 4. P. 1567–1587. PMID: 12930761.

Frisman L.V., Brykova A.L. Monitoring of the Genetic Structure of the Sable Population (Martes zibellina Linnaeus, 1758) in the Middle Amur Region // Russian Journal of Genetics. 2023. Vol. 59, N 4. P. 375–384. DOI: 10.1134/S1022795423040038.

Modorov M., Monakhov V., Mikryukov V., Erokhin N., Tkachenko I., Polezhaeva M., Ranyuk M. Microsatellite multiplex assay for sable (Martes zibellina) and pine marten (Martes martes) // Mammal Research. 2020. Vol. 65. P. 855–862. DOI: 10.1007/s13364-020-00529-4.

Ranyuk M., Modorov M., Monakhov V., Devyatkin G. Genetic differentiation of autochthonous sable populations in Western and Eastern Siberia // Journal of Zoological Systematics and Evolutionary Research. 2021. Vol. 59. P. 2539–2552. DOI: 10.1111/jzs.12565.

Smulders M.J.M., Van Der Schoot J., Arens P., Vosman B. Trinucleotide repeat microsatellite markers for black poplar (Populus nigra L.) // Molecular Ecology Notes. 2001. Vol. 1, N 3. P. 188–190. DOI: 10.1046/j.1471-8278.2001.00071.x.


Ссылки

  • Ссылки не определены.